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主要刊登土壤资源与利用、植物营养与肥料、农业水资源利用、农业微生物、土壤肥料分析测试、新型肥料和制剂的研制与应用、环境保护、生态农业等方面的新理论、新成果、新技术、新产品、新方法，以及国内外发展动态等。

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辟有专家论坛、专题综述、研究报告、分析方法、研究简报、专题讲座、科技动态、信息窗等栏目。读者对象为农业科研、教学、推广、环保、行政管理及肥料生产、经营部门的科技、管理人员及农民技术员。

《中国生态农业学报》原名《生态农业研究》，1993年创刊，中国科学院遗传与发育生物学研究所和中国生态经济学会主办，科学出版社出版。系中国期刊方阵双效期刊、中国科技核心期刊，中国科技论文统计源刊、万方数据库统计源刊、