据中国科技论文与引文库和中国科学引文库的，医学杂志的被引频次连续数年在中国医学期刊中位居前十名（由《中国科技期刊引证报告》，2003 年是医学类第五名，2004 年是医学类第三名），影响因子连续五年呈上升趋势，在综合类医学期刊中始终位居前五名（由 《中国科技期刊引证报告》，2003 年是医学综合类第三名，2004 年是医学综合类第四名）。1992年和1996年，医学杂志分别荣获首届和第二届全国优秀科技期刊一等奖； 1999年荣获首届期刊奖；2002 年荣获第二届期刊奖 ,2004 年荣获第三届期刊奖， 连续四年荣获中国百种杰出学术期刊称号。
据中国科技论文与引文库和中国科学引文库的，医学杂志的被引频次连续数年在中国医学期刊中位居前十名（由《中国科技期刊引证报告》，2003 年是医学类第五名，2004 年是医学类第三名），影响因子连续五年呈上升趋势，在综合类医学期刊中始终位居前五名（由 《中国科技期刊引证报告》，2003 年是医学综合类第三名，2004 年是医学综合类第四名）。1992年和1996年，医学杂志分别荣获首届和第二届全国优秀科技期刊一等奖； 1999年荣获首届期刊奖；2002 年荣获第二届期刊奖 ,2004 年荣获第三届期刊奖， 连续四年荣获中国百种杰出学术期刊称号。