外文文献一般构建系统进化树时，大都采用paup，很少有用mega的。如果是一般的SCI用MEGA没有问题，不过像ME、MPE等文章，MEGA用的相对较少，PAUP相对来说比较权威，以前用的较多，不过其命令行编译比较麻烦，而且可能会导致运算速度很慢。强烈建议使用专门的建树软件，如Phylip、PhyML等。祝好
外文文献一般构建系统进化树时，大都采用paup，很少有用mega的。
如果是一般的SCI用MEGA没有问题，不过像ME、MPE等文章，MEGA用的相对较少，PAUP相对来说比较权威，以前用的较多，不过其命令行编译比较麻烦，而且可能会导致运算速度很慢。强烈建议使用专门的建树软件，如Phylip、PhyML等。祝好