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两歧双歧杆菌ATCC 29521在小鼠肠道的定植分析

更新时间:2016-07-05

近年来,肠道微生物群与人类健康相关的研究层出不穷,已成为微生物研究的一大热点。FAO/WHO将益生菌定义为在适量运用的前提下,活的能够调节菌群达到平衡状态并有益于宿主健康的微生物[1]

双歧杆菌是益生菌的典型代表,在婴儿期广泛定值于人类肠道中,可以刺激系统性及肠道局部免疫系统,促进TH1 / TH2达到平衡状态[2]。不同的菌株可以促进不同疾病的治疗和恢复,如在过敏、乳糜泻、感染性肠炎、坏死性肠炎等疾病的治疗中都取得不错的疗效[3]。也有研究发现双歧杆菌的组成、多样性以及相对丰度发生变化后可能导致某些疾病的发生如肥胖[4]

到目前为止,已经发现双歧杆菌属有48个类群分属6个不同的系统发育组,[5-6],比较基因组学分析发现,两歧双歧杆菌含有参与粘蛋白分解的高度保守的预测基因序列[7],它在生长代谢过程中可以分泌一种胞外多糖[8-9]。两歧双歧杆菌在肠道中的量随着成年人年龄的增长而逐渐减少[4],因此,我们希望通过检测小鼠粪便中两歧双歧杆菌ATCC 29521的量来了解其在肠道中的定植情况。

从决策阶段、设计阶段、施工阶段及运营阶段的建设工程全寿命周期的角度,构建与工程管理类本科课程体系相匹配的案例库[6],并开展多种形式的信息化教学活动,如蓝墨云班课、雨课堂、慕课(MOOC)等进行案例教学,同时通过互联网实现大数据记录对教育和学习行为进行高效管理,将教学形式由课上延展到课下,实现学生即时自主学习、师生即时互动,形成以分析解决真实案例为主体的考核方式[7]。

1 材料与方法

1.1 材料

1.2.3 粪便总DNA提取 粪便每个样品取200 mg,按照QIAGEN粪便基因组DNA试剂盒说明书提取总DNA。

3.1.3细长纺锤形应用于矮砧密植园。定植当年,如果选用3年生大苗,定植时尽可能少修剪。不定干或轻打头,仅去除直径超过主干干径1/3的小主枝。如果用2年生的苗木,在1.0~1.2米饱满芽处定干。萌芽后严格控制主枝生长势,一般新梢长度达到25~30厘米时进行拉枝,角度90~110度,培养强健的中心干,中心干上培养18~25个小型化主枝(粗度小于分枝处1/3干径),整形完成后树高控制在3.5~4.0米。

1.2.4 引物序列的设计 依据B.bi fi dum ATCC 29521 16S rRNA基因序列应用Premier 5. 0设计特异性PCR引物,使RT-PCR产物片段包含在PCR产物片段内(表1):

经验模态分解方法假设所有信号都是由若干个固有模态函数(intrinsic modefunction,IMF)和一个残余量(residual volume,RV)组成,其中IMF满足以下两个条件:1)信号的极值点个数与过零点个数之差必须等于或小于1;2)信号的上、下包络线的均值为0。通过经验模态分解,任何信号s都可以表示为

1.2 方法

1.2.1 养菌及集菌 B.bi fi dum ATCC 29521复苏后,在加入0.05% L-半胱氨酸及其盐酸盐的MRS液体培养基并置于厌氧灌中培养24 h,倍比稀释计数后室温下4 500 r/min离心取得菌斑,再用生理盐水洗涤两次,最终用生理盐水配备成混悬液。

1.2.2 实验动物分组及处理 小鼠适应性喂养一周后,随机分为2组,单次灌胃组予1×109CFU(溶于0.5ml生理盐水)灌胃一次,连续灌胃组予1×109CFU每天早上灌胃一次,连续3周。单次灌胃组于灌胃后 0、2、4、6、8、10、12、16、20、24 h收取粪便,连续灌胃组于灌胃前、灌胃1、2、3周后,灌胃停止3 d及1周后(即0、7、14、21、24、28 d)取粪便,并置于-80℃冰箱。

1.1.1 实验动物 SPF级C57BL/6雌性小鼠,8 ~10 周龄,20 ±2 g,购于北京维通利华实验动物技术有限公司,合格证号为SCXK(京)2012-0001。饲养于SPF环境,室温(22 ±2)℃,自由进食及饮水。

割台装置采用作物夹持切割的方法将向日葵籽盘和秸秆完全分离,利用软收集装置收集不会对收割后的向日葵籽盘造成机械损伤。

1.1.2 实验菌株及试剂 两歧双歧杆菌(Bi fi dobacterium bifidum,B.bifidum ATCC 29521 American Type Culture Collection, ATCC)。MRS培养基购自北京陆桥公司。10×PCR Buffer,dNTPS,TaqDNA聚合酶均购自TakaRa大连宝生物工程公司; Fast SYBR Green Master Mi×(2×) AB公司;引物设计及测序由上海生工公司完成;细菌基因DNA试剂盒购于北京天根生化公司DNA试剂盒购于德国QIAGEN公司

表1 本研究中所用引物 Table 1 Primers used in this study

Name Primer sequences Amplif i ed fragment B. b-PF CTACGGGAGGCAGCAGTG 675 B. b-PR CGAAGGGAAACGCCATCT B. b-QF CTACGGGAGGCAGCAGTG 111 B. b-QR TTGCTCCCAAACAAAAGA

1.2.5 标准曲线的制作

平常我听到大雷声都要哭的,那一天却没有哭,就像第一次被鹅咬到屁股,意外多过惊慌。最奇异的是,雨虽是那样大,离我和母亲的位置不远,而我们站的地方阳光依然普照,母亲也没有要跑的意思。

1.1.3 主要仪器及设备 厌氧罐,实时定量及普通PCR仪,微量分光光度计,电泳仪及凝胶成像分析系统,-80℃低温冰箱,恒温金属浴等。

(2)标准品的制备 B.bif i dum ATCC 29521加入溶菌酶1 h破壁后,按照天根细菌DNA试剂盒说明书提取DNA,行普通PCR扩增后,送上海生工测序,结果相符。测定DNA浓度,计算拷贝数,按10倍稀释为 107 ~ 103copy/μl为标准品。

(1)PCR及QPCR体系及条件:PCR体系:总量 30 μl, buffer 3 μl,dNTP 2.4 ul,上下游引物(F 0.3 μl,R 0.3 μl),Taq 0.15 μl,模板 5 μl,ddH2O 18.85。扩增条件 :95℃ 预变性 5 min ;95℃ 变性 40 s,56.6℃ 退火 40 s,72℃ 延伸 50 s,30 个循环 ;最后72℃ 延伸 5 min。实时荧光定量PCR体系:总量 20ul,Fast SYBR Green Master Mi × 10 μl,双歧杆菌属上下游引物(F 0.8 ul ,R 0.8 μl),模板 2 μl,ddH2O 6.4 μl。扩增条件 :95℃ 预变性 5 min,95℃变性 15 s,,52℃ 退火 10 s,72℃ 延伸 15 s,50 个循环。熔解条件:从 72℃升至 95℃,保持5 s,再降至65℃,保持 1min。

1.2.6 样品检测 按照制作标准曲线的同等条件和体系,将待测粪便DNA样品进行实时荧光定量PCR反应,实验同时设标准品为阳性对照和ddH2O为阴性对照。

2 结 果

2.1 基因组及PCR产物电泳结果 将提取的DNA用微量分光光度计检测,A260/280介于1.8 ~ 1.9之间,粪便DNA组浓度在400 ~ 800 mg/L之间,琼脂糖凝胶电泳检测时,粪便DNA有明显主条带出现;将B.bif i dum DNA作为模板进行普通PCR扩增后,电泳后可见条带清晰,目的片段位置正确(图1)。

图1 不同时间点粪便DNA及B.bif i dum PCR扩增产物电泳结果 Figure 1 Agarose gel electrophoregram of DNA of mice feces and PCR products of B.bif i dum

注:M为DNA Maker,分子量为1 000 bp,CON为阴性对照ddH2O模板,BB1、BB2为双歧杆菌PCR产物2个重复孔。

2.2 标准曲线输出 将已知拷贝数的标准品按照10倍梯度稀释后,行实时荧光定量PCR后可得到其相对应的CT值,以CT值为横坐标,标准品各个稀释度的菌数对数为纵坐标,可得到线性标准曲线,曲线的方程为:y = 0.1835x + 9.0628,相关系数R2为0.9994(图2)。检测样品时将实时荧光定量PCR反应过程中达到荧光阈值所需的初始循环数,代入标准曲线方程中,即得到样品的菌数对数,换算成Ncfu/g即可得知样品中菌数结果。

图2 实时荧光定量PCR标准曲线 Figure 2 Standard Curve of RT-PCR

2.3 单次灌胃组双歧杆菌定量结果 小鼠单次灌服 1×109 CFU 菌液后,于 0、2、4、6、8、10、12、16、20、24 h收取粪便并提取DNA行实时荧光定量PCR检测。整体菌量变化呈先升高后降低趋势,在0 h、灌胃2 h后均未检测到,4h后开始逐渐升高,10h菌量达到最高峰为6.0×107 CFU/g粪便,之后菌量逐渐下降,灌胃12至16 h区间下降幅度最大,24 h后只检测到少量菌体(图3)。

3.在心理维度的测量中,“民营企业关爱员工的方式”和“非工作时间福利的方式”是最重要的两个指标。另外两个指标“对社会文化的发展”和“对生态与人文环境保护”权重较低,说明若民营企业在这些方面表现不好,不会引起强烈不满。

图3 单次灌胃组不同时间点小鼠粪便双歧杆菌菌量变化 Figure 3 B.bifidum numbers in different time points of mice in singal dose group

2.4 连续灌胃组双歧杆菌定量结果 连续灌胃组小鼠每天灌服1×109 CFU菌液,共3周,于0、7、14、21、24、28 d收取粪便。灌胃1周后菌体量达2.0×107 CFU/g,2周后上升至 1.0×108 CFU/g,3周后菌量增加不明显,为1.1×108CFU/g,由此可见灌胃1周内菌体量升高较明显,2周时体内菌体量已经达到平台期,停止灌胃后菌量逐渐下降,停止1周后降至4.8×105 CFU/g,但仍高于灌胃前水平(图4)。

图4 连续灌胃组不同时间点小鼠粪便双歧杆菌菌量变化 Figure 4 B.bif i dum numbers in different time points of mice in successive administration group

3 讨 论

随着16SrRNA、宏基因组测序等新技术的开展,肠道菌群的研究越来越深入,对人类健康的影响也更加受到关注。人们逐渐认识到肠道菌群与宿主之间相互依赖相互影响相互制约,作为体内最大的“器官”,微生物与宿主的消化、免疫以及代谢能力息息相关,也可以说它关乎我们整个健康状态[10]

双歧杆菌作为传统的生态益生菌菌种,在食品添加及辅助药物中都扮演着重要角色。有研究报道双歧杆菌在多种疾病中减少,包括2型糖尿病[11-12]、炎症性肠病[13]、结肠癌[14]等。同时,双歧杆菌具有纠正肠道菌群紊乱、生物拮抗和免疫调节等功能。其中双歧杆菌对炎症性肠病的作用更是广为报道,Wei等[15]发现α-MSH与双歧杆菌结合后其分泌能力及活性未改变,双歧杆菌可作为媒介携带MSH到肠道中预防IBD的复发,产生抗炎作用。两歧双歧杆菌可以促进宿主后天免疫系统的进化及成熟[16],如两歧双歧杆菌 Z9可以调节小鼠树突状细胞的相关基因表达[17]。也有研究发现两歧双歧杆菌ATCC 29521可以调节小鼠肠道菌群,有选择性地增加某些菌如乳酸菌的增植同时打击某些菌的定植,可以促进益生菌生长同时抑制病原菌繁殖[18]。因此两歧双歧杆菌对于临床疾病的治疗作用仍有待于开发及验证,而了解它在体内的定植情况可以帮助指导临床用药。

尽管测序技术可以检测到很多无法通过普通培养得到的细菌,但是在某个菌株的定量检测上却有限制。而实时荧光定量PCR 因其敏感性高、特异性强、重复性好的特点,被广泛用于微生物研究中,它的主要优势在于可以确定样本中菌种的菌体数量[19-21]。益生菌发挥功效的活细胞数量最低应该保持在1.0 ×106到1.0 ×108CFU/g之间[22]。李让等[23]研究了长双歧杆菌BBMN68在大鼠胃肠道中的分布情况,大鼠灌服菌液后,检测大鼠胃、小肠、结肠、直肠不同部位内容物的菌体含量,发现结肠、直肠中的活菌量最多且双歧杆菌在结肠中会增殖,直肠内容物在灌胃后12 h达到高峰,这与本研究的结论相符,我们发现灌服小鼠后10 h左右达到高峰,这可能与小鼠消化道明显较大鼠的短有关,且利用检测粪便中的含量来评估菌体定植情况具有无创伤性、操作方便、依从性好等特点,更适用于以后临床病人的检测评估。连续灌胃组小鼠在第一周内菌体量升高幅度最明显,也就是说刚开始给药时菌体更容易在体内定植,到第2周时达到平台期,这说明菌群的定植可能类似受体效应,当达到一定量时,受体饱和,菌群缺乏位点,则无法继续增殖。因此说明在治疗运用时,两歧双歧杆菌ATCC 29521的给药周期至少需要2周,此后继续增加给药时间不会明显增加体内菌量,体内已经达到定植-排泄平衡状态,但停止灌胃1周后,菌量明显下降,也就是说如果要维持此菌的治疗作用,需要持续给药,使体内的有效菌量维持在平台期。

【参考文献】

[1]Groeger D, O’Mahony L, Murphy EF et al. Bifidobacterium infantis 35624 modulates host inf l ammatory processes beyond the gut. Gut Microbes, 2013, 4(4): 325-339.

[2]Menard O, Butel MJ, Gaboriau-Routhiau V, et al. Gnotobiotic mouse immune response induced by Bif i dobacterium sp. strains isolated from infants. Appl Environ Microbiol, 2008, 74(3): 660-666.

[3]Di Gioia D, Aloisio I, Mazzola G, Biavati B. Bif i dobacteria: their impact on gut microbiota composition and their applications as probiotics in infants. Appl Microbiol Biotechnol, 2014, 98(2):563-577.

[4]Arboleya S, Watkins C, Stanton C, et al. Gut Bifidobacteria Populations in Human Health and Aging. Front Microbiol, 2016,7: 1204.

[5]Turroni F, Foroni E, Pizzetti P, et al. Exploring the diversity of the bif i dobacterial population in the human intestinal tract. Appl Environ Microbiol, 2009, 75(6): 1534-1545.

[6]Turroni F, Peano C, Pass DA, et al. Diversity of bifidobacteria within the infant gut microbiota. PLoS One, 2012, 7(5): e36957.

[7]Turroni F, Milani C, van Sinderen D, et al. Genetic strategies for mucin metabolism in Bif i dobacterium bif i dum PRL2010: an example of possible human-microbe co-evolution. Gut Microbes,2011, 2(3): 183-189.

[8]Li S, Chen T, Xu F, et al. The beneficial effect of exopolysaccharides from Bifidobacterium bifidum WBIN03 on microbial diversity in mouse intestine. J Sci Food Agric, 2014, 94(2): 256-264.

[9]Boue J, Basso L, Cenac N, et al. Endogenous regulation of visceral pain via production of opioids by colitogenic CD4(+) T cells in mice. Gastroenterology, 2014, 146(1): 166-175.

[10]Vieira AT, Teixeira MM, Martins FS. The role of probiotics and prebiotics in inducing gut immunity. Front Immunol, 2013, 4:445.

[11]Le KA, Li Y, Xu X, et al. Alterations in fecal Lactobacillus and Bif i dobacterium species in type 2 diabetic patients in Southern China population. Front Physiol, 2012, 3: 496.

[12]Wu X, Ma C, Han L, et al. Molecular characterisation of the faecal microbiota in patients with type II diabetes. Curr Microbiol, 2010, 61(1): 69-78.

[13]Joossens M, Huys G, Cnockaert M, et al. Dysbiosis of the faecal microbiota in patients with Crohn’s disease and their unaffected relatives. Gut, 2011, 60(5): 631-637.

[14]Gueimonde M, Ouwehand A, Huhtinen H, et al. Qualitative and quantitative analyses of the bifidobacterial microbiota in the colonic mucosa of patients with colorectal cancer, diverticulitis and inf l ammatory bowel disease. World J Gastroenterol, 2007,13(29): 3985-3989.

[15]Wei P, Yang Y, Ding Q, et al. Oral delivery of Bif i dobacterium longum expressing alpha-melanocyte-stimulating hormone to combat ulcerative colitis. J Med Microbiol, 2016, 65(2): 160-168.

[16]Lopez P, Gonzalez-Rodriguez I, Gueimonde M, et al. Immune response to Bif i dobacterium bif i dum strains support Treg/Th17 plasticity. PLoS One, 2011, 6(9): e24776.

[17]Weiss G, Rasmussen S, Nielsen Fink L, et al. Bif i dobacterium bifidum actively changes the gene expression profile induced by Lactobacillus acidophilus in murine dendritic cells. PLoS One,2010, 5(6): e11065.

[18]Wang BG, Xu HB, Xu F, et al. Eff i cacy of oral Bif i dobacterium bif i dum ATCC 29521 on microf l ora and antioxidant in mice. Can J Microbiol, 2016, 62(3): 249-262.

[19]张力文, 王宗润, 吴秀丽, 等. 实时荧光定量PCR法检测人粪便中双歧杆菌方法的建立及评价. 吉林大学学报(医学版)2014,40(3): 686-691.

[20]王宗润, 张力文, 王宗美, 等. 实时荧光定量PCR法检测人粪便中艰难梭状芽孢杆菌. 中国卫生检验杂志, 2015(3): 305-307.

[21]蒋 曼, 姚 萍, 杨 涛, 等. 实时荧光定量PCR法研究溃疡性结肠炎患者肠道双歧杆菌属、柔嫩梭菌属及拟杆菌属量的变化. 中国微生态学杂志, 2013,25(11): 1245-1249+1254.

[22]Marteau P, Rambaud JC. Potential of using lactic acid bacteria for therapy and immunomodulation in man. FEMS Microbiol Rev, 1993, 12:(1-3): 207-220.

[23]李 让, 乔雪薇, 刘松玲, 等. 长双歧杆菌BBMN68在胃肠道中生物分布规律研究. 中国乳业, 2015(10): 72-76.

翁一洁,谭文凯,梁坚,喻才元,陈宗浩,江丹贤
《肠外与肠内营养》2018年第2期文献

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